• 至本醫療:靠獨創的生物信息分析算法和大數據平臺稱雄基因檢測領域


    來源:中國產業經濟信息網   時間:2018-11-19





      文/阿基
     

      蘋果公司創始人史蒂夫·喬布斯是世界上最早嘗試基因檢測治療癌癥的人。2004年,當他發現自己被確診患有胰腺癌后,曾花費10萬美元,請哈佛大學幾個教授幫助自己進行了基因檢測,延續了8年的壽命,創造了癌癥治療的奇跡。
     

      2010年,在風險資本的幫助下,當年幫助喬布斯進行基因檢測的那幾位哈佛大學教授創辦了基因檢測創業公司Foundation Medicine(以下簡稱:FMI),比爾·蓋茨、Google Venture都是它的股東。2013年,FMI成功在美國納斯達克上市。FMI從創辦之初到現在,一直在引領全球精準醫療的革命,直接影響了全球10幾萬患者的治療,以及數十個創新藥物的研發。
     

      基因檢測技術發展到今天,不僅在治療上有重大意義,在疾病預防上同樣至關重要。2013年5月,奧斯卡影后安吉麗娜·朱莉發現自己有患乳腺癌的風險,她通過基因檢測和相應的手術將患病風險從87%降到了5%。
     

      美國是基因檢測技術最發達,商用化程度最高,以及政策最開放的國家,Illumina、FMI、LifeTechnologies和23andMe等公司是全球基因檢測領域的領頭羊。中國是在基因檢測技術領域追趕美國的國家之一,一大批新創公司在近幾年成立。至本醫療(上海)科技有限公司(以下簡稱:至本醫療)是目前中國領先的頭部基因檢測技術公司,它的創始人王凱在FMI成立之初就加入進去,后來成為其主要技術負責人之一,同時,他也是FMI負責企業文化制定的7人委員會成員。可以說,至本醫療是國內最具有FMI氣質的基因檢測公司。

      

    1.jpg
     

      圖:至本醫療創始人王凱
     

      2015年,隨著中國十三五規劃中寫入“精準醫療”等內容,基因檢測在中國發展的政策大門被打開,王凱看到了機會,在家人的支持下,放棄了在美國的優渥工作和生活,返回中國創業,成立了至本醫療。他希望通過自己在海外多年學習、工作掌握到的先進基因檢測技術,為中國的精準醫療事業貢獻自己的力量。
     

      一直站在世界基因檢測最前沿
     

      從2001年至今,十七年的時間,王凱見證了基因檢測技術從一代到二代的技術跨越,也見證了基因檢測技術從實驗室走向商用的全歷程。
     

      2001年,從白求恩醫科大學臨床專業畢業后,在中國科學院院士、中國科學院生物物理研究所研究員陳潤生的引領下,王凱進入基因檢測領域,加入了華大基因公司,接觸到Sanger一代測序儀和生物信息學。
     

      華大基因為王凱打開了基因檢測世界的大門。在華大基因工作期間,他參與了“人類基因組計劃”的收尾工作,還參加了中國水稻和家豬基因組計劃,并發表了人生的第一篇學術文章。
     

      2003年,王凱從華大基因辭職,到當時世界生物信息學最權威的大學——丹麥科技大學生物序列分析中心(CBS)攻讀生物信息學研究生。他的導師Søren Brunak教授是生物信息學的早期奠基人之一,曾任著名的Ensemble數據庫主席,ISMB主席,以及歐洲生物信息學中心主席等。
     

      在CBS讀書期間,他參與了DNA元件百科全書計劃(Encyclopedia of DNA Elements,簡稱:ENCODE計劃)。ENCODE計劃是美國國家人類基因組研究所在2003年9月發起的項目,它也是繼“人類基因組計劃”后,全球最重要的基因檢測項目,它在人類基因測序基礎上,對序列的基因結構和功能識別進行研究。
     

      到2007年,基因二代測序(Next Generation Sequencing,以下簡稱:NGS)技術逐漸成熟,王凱有機會接觸到最先進的基因測序技術。2008年,王凱獲得資助進入美國加州洛杉磯分校(UCLA)生物信息學系主任克里斯托弗·李(Christopher Lee)教授的實驗室專注做癌癥NGS項目,完成博士課題。
     

      2010年,博士畢業后,王凱進入哈佛大學和Dana Farber癌癥研究所,開始博士后學習階段。他加入了生物信息學的傳奇人物DCHIP的牛人李程教授的實驗室,繼續從事癌癥和NGS的相關臨床研究。
     

      李程教授一直致力于研究高通量基因組學數據處理算法、軟件開發和在癌癥基因組學研究中的應用。其所在實驗室開發的dChip、ComBat系列數據分析算法和軟件被廣泛應用于基因表達和SNP生物芯片的數據分析和可視化,文章被引用3000余次。2013年,李程教授全職加入北京大學生命科學學院后,建立了干濕結合的癌癥基因組學實驗室,為中國培養融合生物、信息、數學、工程等交叉學科背景的人才。
     

      2011年秋天,王凱在結束了哈佛大學的博士后研究工作后,加入到FMI,在生信組負責優化基因拷貝數分析流程和建設數據可視化。
     

      FMI是基因檢測領域的明星公司。它成立于2010年4月,由生物醫療技術領域專業投資機構三石風險投資公司(ThirdRockVentures,以下簡稱:三石風投)創辦。三石風投由美國生物技術公司千禧制藥(MillenniumPharmaceuticals)創始人Mark Levin、千禧制藥公司COO Kevin Starr和千禧藥業研發總監Bob Tepper共同發起成立的一家風險投資機構。目前,三石風投是全球醫療生物科技領域最專業的投資機構。
     

      在FMI成立后的首輪融資中,微軟創始人比爾·蓋茨、Google Ventures、俄羅斯億萬富翁尤里·米納爾和美國診斷界的傳奇人物埃文·瓊斯先后成為其投資人。
     

      2012年,王凱加入FMI工作后,他親眼見證了NGS測序結果挽救了一個垂危病人生命的案例,讓他永生難忘。當時,一位不到40歲的骨肉瘤患者已有肺轉移在ICU大部分時間昏迷,無法吞咽,已經下了病危通知。在家屬堅持下拿到了NGS測序結果,提示針對某個基因的擴增的用藥,但由于沒有任何先例經驗醫生開始是反對這樣的治療。后來病人嘗試用藥后48小時出了ICU,兩周后出院。基因檢測技術能指導臨床治療,并且成功挽救生命,這件事讓王凱體會到了前所未有的成就感。
     

      2013年,FMI成功在納斯達克上市,從成立到IPO只用了三年時間。2015年,瑞士制藥商羅氏控股以10.4億美元收購FMI,2018年6月,羅氏控股又以24億美元收購FMI剩余股票,FMI的估值達到54億美元。
     

      先進的生物信息分析算法和大數據平臺
     

      2015年,王凱回國成立了至本醫療,2016年9月,成功獲得IDG、松禾資本和火山石資本的6000萬人民幣的天使輪融資。后來又在A、B輪融資中獲得了多家知名投資機構的認可和青睞。
     

      至本醫療主要將針對癌癥的全面、準確的分子信息檢測用于臨床治療指導,這是王凱和他團隊擅長的領域。在整個基因檢測產業鏈上,上游為測序儀及試劑耗材,中游為基于測序服務和生物信息分析的各項服務,下游為終端市場。其中,上游主要被美國公司占據,中游是中國基因檢測公司最活躍的市場。
     

      至本醫療最大的創新在于生物信息分析算法,這也是其核心的行業競爭力。其獨立研發了OriFusion、OriCNV、OriIndel、OriSNV、OriTMB、OriMSI和OriLongIndel等生物信息分析算法,獲得了一系列專利授權,保證了基因樣本分析更加嚴格、精準和全面。
     

      2017年5月,至本醫療發表的一篇題為“A novel approach to detect large indels from targeted sequencing data in clinical cancer setting.”的文章被全球最大,也是最具影響力的腫瘤組織美國臨床腫瘤學會年會(American Society of Clinical Oncology,以下簡稱:ASCO)正式接收,文章最大的亮點是至本醫療自主研發的OriLongIndel算法。
     

      同時,至本醫療已經建立了針對中國人群的全面精準的基因數據庫和臨床數據庫。2018年9月21日,在中國腫瘤大會CSCO上,至本醫療與北京希思科(CSCO)臨床腫瘤學研究基金會、東方腫瘤臨床研究中心共同啟動了中國特色癌種基因信息學大數據平臺,預示了中國基因測序行業正式進入了臨床數據與基因數據整合的大數據時代。
     

      目前,CSCO有近2萬名腫瘤醫生注冊,積累了龐大的臨床大數據。至本醫療科技作為主要參與者之一,利用生物信息學分析的獨特優勢,將主導大數據平臺中的基因檢測和分析版塊。
     

      中國特色癌種基因信息學大數據平臺啟動后,至本醫療將為第一階段入駐的近40家醫院的2000多名不同瘤種患者提供WES全外顯子測序及部分元溯450+個癌癥核心基因的深度測序,并提供針對性的臨床治療方案。
     

      元溯450是至本醫療的主打產品,可以覆蓋450+個癌癥核心基因的檢測,WES全外顯子測序則是至本醫療的深度測序產品服務。
     

      隨著基因檢測的大panel檢測成為主流趨勢,未來算法和大數據在基因檢測中的重要性會越來越大。目前的基因檢測只用2天就可以出現10個G左右的檢測數量,未來的數據流會更加龐大。
     

      除了算法和大數據平臺,至本醫療還有很多“黑科技”,比如基因檢測中的“大片段的插入缺失”技術,突破了二代測序在測序方面的瓶頸,成為國內唯一實現這項突破的企業。
     

      此外,至本醫療還創建了6大自主知識產權平臺的基因檢測中心;擁有知識庫建設、報告自動化及流程一體化等10項軟件著作權專利的信息處理超算中心。
     

      至本醫療在技術上的先進性吸引了國家頂級專家的加入。2017年8月,至本醫療科技宣布全球癌癥基因組學專家Matthew Meyerson教授正式加入至本醫療科技擔任科學顧問委員會主席。Matthew Meyerson教授是享譽全球的腫瘤基因組學專家。同時,他也是FMI的創始人之一,現任全球最著名的基因組研究中心Broad Institute(哈佛大學和MIT合辦)主任,手下管理著十余位諾貝爾獎獲得者。2014年,Matthew Meyerson教授被湯森路透社評為“全球最有影響力的科學家”之一。
     

      2017年11月7日,至本醫療獲“國家高新技術企業”稱號,它是一家名副其實的高科技公司,具備成為基因檢測領域獨角獸的潛力。
     

      國際基因檢測領域的頂級企業也開始與至本醫療進行合作。2018年7月11日,至本醫療與美國基因測序儀器供應商Illumina公司達成合作協議, Illumina將提供二代測序儀器和相關試劑,至本醫療科技將專注于腫瘤分子檢測領域的臨床應用轉化,并提供自主研發的生物信息算法專利技術和強大的數據分析能力。Illumina公司曾被《麻省理工科技評論》評為“2014年度全球創新企業50強”公司。
     

      在終端應用上,2017年5月,至本醫療開發了“土撥鼠博士”APP,用戶可以實現電子報告在線查看、精準數據一鍵查詢、患者管理&隨訪管家、醫醫在線互相交流等功能,這也屬于業內首創。
     

      在合作的醫院方面,至本醫療已經和國內超過三百家醫院達成合作,臨床案例累積上萬例左右。
     

      通過對至本醫療創業以來歷程的回顧,可以說,至本醫療是國內最具有FMI氣質的基因檢測公司。王凱不但見證了FMI從30幾個人起步發展壯大的全過程,也深度參與了FMI的組織管理工作,深受FMI文化影響。他認為,FMI對團隊合作和個人尊重等文化非常看重,“公司發展到了100人的時候,FMI計劃重新修訂內部文化,我很榮幸加入到了企業文化制定的7人委員會,我們定期開會討論,最終形成了傳承至今的企業文化主張”,FMI并沒有在快速擴張中失去了企業價值觀、凝聚力和創新動力,因此能夠吸引到一大批有共同理想和使命的牛人,這是它成為行業先行者和領頭羊的重要因素之一。
     

      王凱在FMI文化的基礎上思考怎么結合中國的實際情況找到至本醫療的文化基因。他認為,雖然中美國內環境不同,但是有一點是共通的,那就是“創建一個公司真正的意義并不僅僅是建立有盈利能力的商業模式而已,更主要是通過這幾年實實在在的努力帶來了對癌癥醫療領域的革新性的影響”。
     

      由此可見,至本醫療是一家由使命驅動的高科技公司,它將扛起中國基因檢測行業的理想主義大旗。

          轉自:中國財經新聞網

      版權及免責聲明:凡本網所屬版權作品,轉載時須獲得授權并注明來源“中國產業經濟信息網”,違者本網將保留追究其相關法律責任的權力。凡轉載文章,不代表本網觀點和立場。版權事宜請聯系:010-65363056。

    延伸閱讀

    ?

    版權所有:中國產業經濟信息網京ICP備11041399號-2京公網安備11010502035964

    www.色五月.com